死神动画系列在342集之后，主要剧情转向了"千年血战篇"，这是原作漫画中的最后一个篇章。但不幸的是，该剧情并未在动画中展现，仅在漫画中完成地描绘。动画在366集结束，在该部分内容中主要围绕“代理死神消失篇”，即“黒崎一護失去死神力量以后”的故事展开。
在"千年血战篇"中，死神界遭到了四大死神贵族之一、拥有复活能力的瓦尔德斯特恩贵族的攻击。袭击的的首领“尤瓦巴赫”袭击了尸魂界，为了保护尸魂界，各路力量再次集结。在这个过程中，黒崎一護也重新获得了死神的力量。在这一篇章中，许多角色的过去被揭示，而一護他们的力量也得到了进一步的升华。
在"代理死神消失篇"中，黒崎一護在与最终的敌人完结篇“全知全能”的战斗中，使用了他所有的力量，也失去死神的力量，并回归普通人生活。但是，他在与夏琳及其团队的接触中，一護又获得了全新的格斗技能，“全能”。然后一系列的战斗，一護他们最终成功防止了清王的行动。
至此，动画版的死神也完成了对已发布的原作漫画内容的完全覆盖，而千年血战篇故事因为原作动画系列的提前结束而并未在PA工作室的动画中继续。2020年，死神动画系列的回归已经宣布，将会继续从千年血战篇开始，并且预计将于2021年播出，让我们拭目以待。
