南京不同的地铁线路最早的运行时间是不一样的。一般来说是从早晨到5:40~6:00之间就会发出首班车。比如南京地铁1号线迈皋桥站，就是早晨的5:42。而地铁2号线、地铁3号线，早晨的第1班车都是6点发车。
乘客们在乘坐南京地铁的时候，可以先登录南京地铁集团官网，在上面是有每趟地铁线路具体的列车发车时刻表，可以根据上面的时刻表来确定自己所乘坐的地铁具体的发车时间，然后再发车时间之前到达车站乘车即可。
1、南京地铁1号线运营时间，起点站：迈皋桥 05:42-23:19 | 终点站：中国药科大学 05:47-23:27。
2、南京地铁2号线运营时间，起点站：油坊桥 06:00-23:00 | 终点站：经天路 06:00-23:00。
3、南京地铁3号线运营时间，起点站：林场 6:00-23:00 | 终点站：秣周东路 6:00-23:00。
4、南京地铁10号线运营时间，起点站：安德门 06:00-23:40 | 终点站：雨山路 05:40-23:00。
5、南京地铁S1号线(机场线)运营时间，起点站：南京南站 6:00-22:00 | 终点站：禄口机场 6:40-22:00。
6、南京地铁S8号线(宁天城际)运营时间，起点站：泰山新村 06:00-22:20 | 终点站：金牛湖 06:00-22:00。
7、南京地铁4号线运营时间，起点站：龙江 6:00-23:00 | 终点站：仙林湖 6:00-23:00。
8、南京地铁S3号线(宁和城际)运营时间，起点站：高家冲 06:00-22:00 | 终点站：南京南站 06:00-22:00。
9、南京地铁S9号线(宁高线)运营时间，起点站：翔宇路南 06:00-22:00 | 终点站：高淳 06:00-22:00。
